Eukaryoty jsou jakýkoli druh organismů, které mají komplexní buňky, které zahrnují mitochondrie, jádra a další buněčné části. Tři hlavní buněčné skupiny jsou houby, rostliny a zvířata. Mnoho hub je spojeno s rostlinami jen povrchně. Mohou vypadat poněkud jako rostliny a mají buněčné stěny, které jsou podobné buněčným buněčným stěnám, ale existuje frenologický strom, který ukazuje, jak mohou být houby více příbuzní zvířatům než rostlinám. Protože zvířata jsou v evoluční historii blíže k hubám než rostlinám, lze říci, že houba je bližší „příbuzenství“ člověku než zelenině na salátovém baru.
Protein
Proteinové sekvence hub jsou více podobné zvířatům než rostlinám. Například protein z buněčné sliznice vypadá spíše jako živočišný protein než rostlinný protein. Délka ribosomů v houbách vykazuje aminokyselinu, která je podobná svalu. Ve skutečnosti existuje několik aminokyselinových sekvencí, které jsou podobné savčím proteinům těžkého řetězce. Jedna z těchto aminokyselin je 81 procent identická s lidskou aminokyselinou.
Chlorofyl
Rostlinná celulóza je jiná než fungální celulóza. Při rentgenování je rostlinná celulóza krystaličtější než fungální celulóza. Houby i zvířata neobsahují chloroblasty, což znamená, že ani houby ani zvířata nemohou zpracovávat fotosyntézu. Chlorofyl způsobuje, že rostliny jsou zelené a zajišťují výživu rostlin. Naproti tomu houby absorbují živiny z rozkladu rostlinného materiálu enzymatickým procesem a zvířata přijímají potravu.
Chitin
Houby i zvířata obsahují polysacharidovou molekulu zvanou chitin, kterou rostliny nesdílejí. Chitin je komplexní uhlohydrát používaný jako strukturální složka. Houby používají chitin jako strukturální prvek v buněčných stěnách. U zvířat je chitin obsažen v exoskeletu hmyzu a v zobácích měkkýšů. Chitin funguje podobně jako rostlinná celulóza, ale chitin je silnější. Studie provedené na polysacharidech z hub ukázaly, že přidání hub obsahujících dusík zničilo houby a vytvořilo kyselinu octovou. K těmto chemickým reakcím nedošlo u rostlinných polysacharidů.
Houby nejsou řasy
Řasy jsou nejjednodušší a nejprimitivnější rostliny. V roce 1955 Dr. George W. Martin dospěl k závěru, že houby pocházejí z řas, které ztratily chlorofyl. Martinova hypotéza však neuvažovala o tom, že by atmosférické podmínky mohly být na počátku života jiné, než jaké byly v roce 1955. Martin také nezohlednil, že bakterie vázající dusík mohly existovat ještě před vývojem rostlin, které mohly být použity jako zdroj potravy pro houby. V roce 1966 Dr. A.S. Sussman poznamenal, že zatímco houby vypadaly povrchně jako řasy, existovaly zde aspekty hub, jako jsou buněčná jádra a organizace, které nelze vysvětlit.
Steroly
Někteří biologové uvedli, že zvířecí a houbové steroly jsou odlišné, proto houby nemohou být podobné zvířatům. Zvířata produkují cholesterol, zatímco houby produkují ergosterol. Při podrobnějším zkoumání fungální i zvířecí steroly obsahují lanosterol, zatímco fytosteroly v zelených rostlinách obsahují cykloartenol.
Je to vlastní kategorie?
Snad houby nejsou odvozeny od rostlin ani jednobuněčných zvířat. Někteří biologové tvrdí, že houby jsou fylogeneticky odlišné od všech ostatních eukaryot. Houby se jeví jako jedinečné v tom, že samy vyžadují faktor prodloužení translace zvaný EF-3. Existují určité proteinové aktivity, které jsou nezbytné pro prodloužení translace in vivo.
